- Kamptonema laetevirens (H.M.Crouan & P.L.Crouan ex Gomont) Strunecký, Komárek & J.Smarda, 2014
- Limnoraphis birgei (G.M.Smith) J.Komárek, E.Zapomelová, J.Smarda, J.Kopecky, E.Rejmánková, J.Woodhouse, B.A.Neilan & J.Komárková, 2013
- Lyngbya aestuarii Liebman ex Gomont, 1892
- Lyngbya birgei G.M.Smith, 1916 accepted as Limnoraphis birgei (G.M.Smith) J.Komárek, E.Zapomelová, J.Smarda, J.Kopecky, E.Rejmánková, J.Woodhouse, B.A.Neilan & J.Komárková, 2013
- Planktothrix suspensa (Pringsheim) Anagnostidis & Komárek, 1988
- Tychonema rhodonema (Skuja) Anagnostidis & Komárek, 1988